\(*\) このプログラムは書籍とは異なっています。
ridge <- function(X, y, lambda = 0) {
X <- as.matrix(X)
p <- ncol(X)
n <- length(y)
X.bar <- array(dim = p)
s <- array(dim = p)
for (j in 1:p) {
X.bar[j] <- mean(X[, j])
X[, j] <- X[, j] - X.bar[j]
}
for (j in 1:p) {
s[j] <- sd(X[, j])
X[, j] <- X[, j] / s[j]
}
y.bar <- mean(y)
y <- y - y.bar
beta <- drop(solve(t(X) %*% X + n * lambda * diag(p)) %*% t(X) %*% y)
for (j in 1:p)
beta[j] <- beta[j] / s[j]
beta.0 <- y.bar - sum(X.bar * beta)
return(list(beta = beta, beta.0 = beta.0))
}
\(*\) このプログラムは書籍とは異なっています。
df <- read.table("crime.txt")
x <- df[, 3:7]
y <- df[, 1]
p <- ncol(x)
lambda.seq <- seq(0,50)
plot(lambda.seq, xlim = c(0, 50), ylim = c(-7.5, 15),
xlab = "lambda", ylab = "beta", main = "各lambdaについての各係数の値",
type = "n", col = "red")
for (j in 1:p) {
coef.seq <- NULL
for (lambda in lambda.seq)
coef.seq <- c(coef.seq, ridge(x, y, lambda)$beta[j])
par(new = TRUE)
lines(lambda.seq, coef.seq, col = j)
}
legend("topright",
legend = c("警察への年間資金",
"25歳以上で高校を卒業した人の割合",
"16-19歳で高校に通っていない人の割合",
"18-24歳で大学生の割合",
"25歳以上で4年制大学を卒業した人の割合"),
col = 1:p, lwd = 2, cex = .8)
curve(x^2 - 3*x + abs(x), -2, 2, main = "y = x^2 - 3x + |x|")
points(1, -1, col = "red", pch = 16)
curve(x^2 + x + 2*abs(x), -2, 2, main = "y = x^2 + x + 2|x|")
points(0, 0, col = "red", pch = 16)
soft.th <- function(lambda, x) {
return(sign(x) * pmax(abs(x) - lambda, 0))
}
curve(soft.th(5, x), -10, 10, main = "soft.th(lambda, x)")
segments(-5, -4, -5, 4, lty = 5, col = "blue")
segments(5, -4, 5, 4, lty = 5, col = "blue")
text(-0.2, 1, "lambda = 5", cex = 1.5, col = "red")
\(*\) このプログラムは書籍とは異なっています。
lasso <- function(X, y, lambda = 0) {
X <- as.matrix(X)
p <- ncol(X)
n <- length(y)
X.bar <- array(dim = p)
s <- array(dim = p)
for (j in 1:p) {
X.bar[j] <- mean(X[, j])
X[, j] <- X[, j] - X.bar[j]
}
for (j in 1:p) {
s[j] <- sd(X[, j])
X[, j] <- X[, j] / s[j]
}
y.bar <- mean(y)
y <- y - y.bar
eps <- 1
beta <- array(0, dim = p)
beta.old <- array(0, dim = p)
while (eps > 0.001) {
for (j in 1:p) {
r <- y - X[, -j] %*% beta[-j]
beta[j] <- soft.th(lambda, sum(r * X[, j]) / n)
}
eps <- max(abs(beta - beta.old))
beta.old <- beta
}
for (j in 1:p)
beta[j] <- beta[j] / s[j]
beta.0 <- y.bar - sum(X.bar * beta)
return(list(beta = beta, beta.0 = beta.0))
}
\(*\) このプログラムは書籍とは異なっています。
df <- read.table("crime.txt")
x <- df[, 3:7]
y <- df[, 1]
p <- ncol(x)
lambda.seq <- seq(0, 200)
plot(lambda.seq, xlim = c(0, 200), ylim = c(-7.5, 15),
xlab = "lambda", ylab = "beta", main = "各lambdaについての各係数の値",
type = "n", col = "red")
for (j in 1:p) {
coef.seq <- NULL
for (lambda in lambda.seq)
coef.seq <- c(coef.seq, lasso(x, y, lambda)$beta[j])
par(new = TRUE)
lines(lambda.seq, coef.seq, col = j)
}
legend("topright",
legend = c("警察への年間資金",
"25歳以上で高校を卒業した人の割合",
"16-19歳で高校に通っていない人の割合",
"18-24歳で大学生の割合",
"25歳以上で4年制大学を卒業した人の割合"),
col = 1:p, lwd = 2, cex = .8)
library(glmnet)
## Warning: package 'glmnet' was built under R version 4.0.3
## Loading required package: Matrix
## Loaded glmnet 4.0-2
df <- read.table("crime.txt")
X <- as.matrix(df[, 3:7])
y <- df[,1]
cv.fit <- cv.glmnet(X, y)
plot(cv.fit)
lambda.min <- cv.fit$lambda.min
lambda.min
## [1] 24.13667
fit <- glmnet(X, y,lambda = lambda.min)
fit$beta
## 5 x 1 sparse Matrix of class "dgCMatrix"
## s0
## V3 9.323552
## V4 -2.070170
## V5 3.186696
## V6 .
## V7 .